民國98年10月23日，臺南市政府公告臺南市立安南醫院BOT案招標。99年3月12日，中國醫藥大學附設醫院榮獲最優申請人；同年6月23日，中國醫藥大學暨附設醫院與臺南市政府簽約，開啟臺南市立安南醫院50年的興建營運期，並於8月6日舉辦動土祈福典禮。100年3月30日開工。中國醫藥大學附設醫院則為各方面迭有傑出表現的醫學中心。在此堅實雄厚的基礎之下，校院依據未來50年的醫療需求來規劃安南醫院，不僅要提供全方位高品質的醫療服務，也要打造具前瞻性與人文關懷的醫療園區，以回饋鄉親的信賴及託付；醫療是救人的志業，安南醫院誓以最優質的醫療團隊、最先進的醫療設備、最好的服務品質，提供全人醫療服務，並將負起市立醫院的責任，加強社區醫療、公共衛生及緊急重大災害的醫療支援。「以病人為尊、以員工為重、以醫院為榮」一直是中國醫藥大學醫療體系恪遵的核心價值，安南醫院也將奉為圭臬，共同為提升臺灣的醫療品質及就醫環境而盡心盡力。
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